本科论文引用在知网找不到的硕士论文，对查重检测肯定是有影响的。

知网查重并不是只检测是否和本网站论文有重复，互联网、历届论文、书籍都会查。不过也不用太过担心，引用部分只要格式正确，没有超出引用的比例，在查重时这部分内容是不算到重复率中的。

本科论文引用在知网找不到的硕士论文，对查重检测有影响。

关于知网相关抽查规定：

有规定的，可以进行第一次修改，修改之后通过就可以答辩，如果第二次不通过就算结业，在之后4个月内还要交论文或者设计的。这个是在抄袭30%的基础上的。 如果抄袭50%以上的话，直接结业 在之后4个月内还要交论文或者设计的。

1、被认定为抄袭的本科毕业设计（论文），包括与他人已有论文、著作重复总字数比例在30%至50%（含50%）之间的，需经本人修改。修改后经过再次检测合格后，方可参加学院答辩。再次检测后仍不合格的，按结业处理。须在3 个月后提交改写完成的毕业设计（论文），检测合格后再参加答辩。

2、被认定为抄袭的本科毕业设计（论文），且与他人已有论文、著作重复总字数比例超过50%的，直接按结业处理。须在4 个月后提交改写的毕业设计（论文），检测合格后再参加答辩。