另一方面，为什么学术查重报告当中部分时期会将参考文献标红呢？这里有以下两个事由，即第一个可能论文撰写者选用不正规的的学术查重软件对论文来查重，而这种不正规的的学术查重软件并不正规的的学术查重，故此没办法识别参考文献，出现参考文献飘红；二是论文的参考文献样式不正确，出现学术查重软件没办法识别该部分参考文献，使得将该参考文献标红，实际上，若该部分参考文献样式准确就会学术查重识别，使得是不会纳入查重范畴以内。
综上所述，学术查重并不包含参考文献，学术查重一般而言只对论文的概要部分、英语概要部分、正文部分及附录部分来查重，而参考文献并不在学术查重范畴以内。所以，论文撰写者不用紧张因要罗列很多参考文献在论文当中。
但，唯有正规的学术才会识别参考文献，并且其还有的一个前置性条件是参考文献样式准确，这也正意味着论文撰写者务必到学术不端网的“学术查重入口”等正规的学术查重平台来查重，且要依据规定编写参考文献，保障学术能够识别。
