然而，学术查重不是能识别全部的参考文献，仅有有些相符格式的参考文献才会学术识别，这也就说明仅有当参考文献格式正规且正确的时候，学术才能将该部分参考文献排出在查重范畴以外。所以，能肯定的说，学术查重不包括格式正确的参考文献。另一方面，怎么学术查重报告中一些时候会将参考文献标红呢？这里有以下两个缘由，即一是有可能论文笔者选用了非正规的学术查重系统对文章进行查重，而这种非正规的学术查重系统并非正规的学术查重，因此不能识别参考文献，引发参考文献标红；二是论文的参考文献格式不正确，引发学术查重系统不能识别该部分参考文献，进而将该参考文献标红，事实上，若该部分参考文献格式正确就会学术查重识别，进而不会纳入查重范畴之中。
综上，学术查重并不包括参考文献，学术查重一般而言只针对论文的纲要部分、外语纲要部分、正文部分及附录部分进行查重，而参考文献并不会在学术查重范畴之中。
所以，论文笔者不用忧心因需要用到罗列非常多的参考文献在论文中。
但，唯有专业的学术才会识别参考文献，除此之外其有一个前置性条件是参考文献格式正确，这也说明论文笔者肯定到学术不端网的“学术查重入口”等专业的学术查重平台进行查重，且要根据要求创写参考文献，保障学术能识别。
