自2019年11月14日，斯坦福大学博士Elisabeth Bik在PubPeer指出曹雪涛存在学术不端，有多达40篇署名曹雪涛的论文被质疑实验图片造假。 随后，中国工程院表示对此问题展开调查。 2020年6月26日，《生物化学杂志》（Journal of biological chemistry，JBC）编辑部在最新一期的杂志中对曹雪涛团队自2003年至2014年期间发表于该刊的12篇论文分别发布了关注声明，对这些论文中的某些数据和结论的可信性表示关注。
该通报对曹雪涛院士论文的调查结论和处理办法是： 对网络质疑曹雪涛院士的63篇论文，经调查「未发现」有造假、剽窃和抄袭，但发现较多论文存在「图片误用」，反映「实验室管理不严谨」。 经联合工作机制审议，决定取消曹雪涛院士「申报国家科技计划项目」资格1年，取消「作为财政资金支持的科技活动评审专家」资格1年，取消「招收研究生」资格1年，责成其对被质疑的论文「回应」质疑并进行「勘误」，对存在的问题作出深刻检查，在工程院相应学部通报批评。
Elisabeth Bik是斯坦福大学博士，也是一名微生物学家，致力于发现论文中有问题的图片。 她在2019年11月提出了曹雪涛论文存在问题。 对于曹的调查结果，她说：「 (该委员会)得出的结论是，这些案件中没有任何欺诈行为，这令人震惊。
曹雪涛院士，中国免疫学专家，中国工程院院士，现任南开大学校长。 1986年于第二军医大学本科毕业，硕士时以总分第一的成绩考入叶天星门下。 其硕士论文得到好评，于是补做半年学习和半年科研后直接获得博士学位。 1992年，他直接被提升为教授。 1996年他帮助第二军大建成博士点，第二年又建成全军重点实验室。 2000年11月当选第11届中国十大杰出青年。 2005年当选为中国工程院医药卫生部院士。 2012年被任命为中国医学科学院院长及北京协和医学院校长。 2018年1月，当选第十三届全国政协委员。 2018年1月接替龚克担任南开大学校长。 接任南开大学校长一职后，曹雪涛提出了「4211卓越南开行动计划」。
