另，为什么知网查重报告文档中一些阶段会将参考文献标红呢？这有以下两类事由，即一是有可能毕业论文作者选用非正规的知网查重软件对论文来查重，而这些非正规的知网查重软件并非正规的知网查重，因而不能识别参考文献，出现参考文献飘红；二是毕业论文的参考文献格式不正确，出现知网查重软件不能识别该部分参考文献，使得将该参考文献标红，实际上，若该部分参考文献格式正确就会知网查重识别，使得不会纳入查重涉及范围是左右。
综上所述，知网查重并不包括参考文献，知网查重一般而言只对毕业论文的提要部分、英语提要部分、正文部分及附录部分来查重，而参考文献并不会在知网查重涉及范围是左右。于是，毕业论文作者不用担心因需要罗列很多参考文献在毕业论文中。但是，唯一仅有合规的知网才能识别参考文献，而且其有的一个前置性情况是参考文献格式正确，这也正表示毕业论文作者必定到学术不端网的“知网查重入口”等合规的知网查重平台来查重，且要按照规定编写参考文献，保障知网可以识别。
