ELISA广泛应用于食品中农药残留如有机磷农药、有机氯农药、除草剂、氨基甲酸酯类农药、兽药残留 (如氯霉素)、真菌毒素等的分析检测上。 作为一种快速筛选方法，EKSIA法在分析复杂基体样品时，因为基体干扰和交联反应等问题，往往存在假阳性的问题。
用于研究农药残留检测的生物传感器所使用的生物物质主要为酶、全细胞、细胞器、受体或抗体等，相应有酶传感器、全细胞传感器和免疫传感器等，尤其是免疫传感器的应用可大大提高检测灵敏度并大大缩短检测时间。 而生物传感器与光纤技术结合的产物——光导纤维传感器，则在快速检测和在线检测中有着广阔的应用前景。
农药残留 (Pesticide residues)， 是农药使用后一个时期内没有被分解而残留于生物体、收获物、土壤、水体、大气中的微量农药原体、有毒代谢物、 降解物和杂质的总称。 施用于作物上的农药，其中一部分附着于作物上，一部分散落在土壤、大气和水等环境中，环境残存的农药中的一部分又会被植物吸收。
