在本次学位论文抽检中，论文规范性欠缺是“不合格论文”存在的第二大问题，占比为29%。 这一问题在自然科学类学位论文中更为突出。 格式规范主要指论文的摘要、关键词、目录、正文、参考文献等格式的规范。
研究重点不突出。 即论文论述没有突出研究重点，缺乏问题意识，研究问题不明确，对论文观点缺乏提炼等。 专家评语如“缺乏严密的逻辑推导。 （法学）”“论证单薄，论文许多部分论证不到位，浅谈辄止。 （教育学）”“论文的主要内容缺少合理的理论框架，显得较混乱。 （历史学）”“文章在内容和结构上严重地偏离了自己的主题。 （文学）” 研究方法单一或不恰当。 即由于论文选用研究方法较少，实验设计不科学，未使用该论题学科领域的研究方法和分析手段等原因，没有运用正确的方法对研究对象进行客观研究，体现不出作者的专业水平和研究能力，从而影响结论的有效性和可靠性。 数据不够真实有效。 即论文所运用的数据资料的可靠性和真实性不足；数据选取不科学，甚至选取错误。 样本选取的科学性不足。
作者的学术态度和学术行为的不端正，也是此次论文抽检发现的较为严重的问题，有7%的专家评语明确提到了“学术态度不端正”或“学风不严谨”。 而从“不合格论文”出现的本质原因而言，都可以归结为作者学术态度的不端正和学风的不严谨。 而学术态度和学术行为，是决定研究和论文质量最根本的因素。 工作量不足，即论文在撰写过程中，作者没有付出必要的时间和精力去完成论文的研究和撰写工作，而是仓促写成，敷衍了事。 存在抄袭现象，即抄袭他人的研究成果或直接照搬相关的文献资料。 值得一提的是，在“不合格论文”中，有部分论文是被专家直接判定为“完全不符合要求”的论文，即无论是从选题还是研究方法、论文的撰写等方面，都不满足硕士论文的基本要求，这些论文无一例外都是由作者学术态度和学术行为不端正所导致的。
理论性或研究深度不足。. 即论文在论述过程中，没有对论题的理论基础进行必要的分析介绍，理论基础薄弱；缺乏理论框架，使论述显得凌乱；论文的研究不够深入，没有对深层次的研究问题进行探究和解答，理论深度不够和缺乏学术性。. 研究重点不突出。. 即论文论述没有突出研究重点，缺乏问题意识，研究问题不明确，对论文观点缺乏提炼等。. 专家评语如“缺乏严密的逻辑推导。. （法学）”“论证单薄，论文许多部分论证不到位，浅谈辄止。. （教育学）”“论文的主要内容缺少合理的理论框架，显得较混乱。. （历史学）”“文章在内容和结构上严重地偏离了自己的主题。. （文学）”.
