论文检测通篇都会查重，参考文献引用就作为引用，别的内容尽量做到重复为0.
论文参考文献随便写查重会被查出来。
如果论文中有引用别人的原文，在查重时是会被标注出来的，格式一定要正确才不会被查重系统视为抄袭;若没有进行标注的话，查重系统是会检测到引用论文的参考文献，就会把这段文字作为正文进行查重检测。
如果出现了标红的现象，那也许是因为参考文献的格式不标准，格式不标准的参考文献查重系统是无法进行识别的，就会被当做正文进行查重检测。
当然，只要论文作者不过多地引用文献内容，参考文献占用论文的比例就不会太多，也就不会对论文的质量以及重复率产生不良的影响。
参考文献被标红：
如果当查重后发现自己论文的参考文献甚至是连论文的目录都被标红了，那么就需要去排查问题的原因了，基本上会发生这种情况都是由于我们在排版的时候格式不规范才导致的。
比如论文当中的脚注并非使用word自动插入，参考文献的格式设置有问题的话，那么就会导致查重系统无法去正确的识别，这样就会把这部分的内容当成是正文内容从而进行检测，这时只需要按照正规的论文格式去重新编辑下就行。
这跟注明不注明没有关系的，论文检测是把您的论文与对比数据库的文献进行逐句对比，相似的就标出来，如果像你所说，你有修改，尤其是逐句修改的话，相似度会下降的，注明了说明你是引用
