论文查重需要把参考文献放进去，其目的有三即：为了能反映出真实的科学依据；为了体现严肃的科学态度，分清是自己的观点或成果还是别人的观点或成果；为了对前人的科学成果表示尊重，同时也是为了指明引用资料出处，便于检索。
根据已有研究成果及经验，一般的基础研究、理论研究论文引用的参考文献数量在10篇左右，综述性论文引用的文献数量可以多一些，技术性、实验性论文引用文献相对较少。 参考文献的选择，应该根据文章的需要来确定，以数量最少、质量最优、作用最佳、成果最新为基本原则。
许多同学都知道论文查重系统不会对封面、目录、标题以及参考文献等内容进行查重，但是在前面提到的是格式正确的前提下，如果格式不正确就不会进行正常查重，如果格式不正确就会作为正文进行查重，这样就增加了论文的查重率。 一般来说致谢是不需要查重检测的，但具体还是要以学校为准。
学术参考文献一般不查重，而且论文的参考文献是一般是不需要查重的，而且学术检测系统时，就算把全部的论文上传上去，学术检测查重系统也是可以识别正确的目录和参考文献并剔除，不参与正文检测。 但是也千万不要图省钱，把参考文献哪些不参考查重的地方省略了。
